電気通信大学 · 情報理工学研究科 · 教授

研究キーワードRNA/DNA Secondary Structure Analysis・計算論的学習理論・文法推論・分子計算・RNA/DNA 二次構造解析・情報学・計算機科学

研究分野情報学基礎・情報学・情報科学・生体生命情報学・知能情報学・知覚情報処理・知能ロボティクス・総合・新領域系・総合領域

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• Improvement of the Size of Control Alphabet for Controlled Generation of Unary Strings of Specified Length Daihei Ise; Satoshi Kobayashi ラスト(シニア)オーサー, to appear in Proc. of 17th Latin American Theoretical Informatics Symposium, 出版日 2026年, 査読付 研究論文（国際会議プロシーディングス）, 英語2026 · 論文
• A Necessary and Sufficient Condition for Controlled Generation of Right Linear Grammars with Unknown Behaviors Daihei Ise; Satoshi Kobayashi 責任著者, IEICE Transactions on Information and Systems, E108.D巻, 6号, 掲載ページ 540-548, 出版日 2025年, 査読付 研究論文（学術雑誌）, 英語 DOI URL2025 · 論文
• Characterizations of Controlled Generation of Right Linear Grammars with Unknown Behaviors. Daihei Ise; Satoshi Kobayashi CoRR, abs/2403.04301巻, 出版日 2024年 研究論文（学術雑誌） URL DOI URL2024 · 論文
• Three step design of DNA sequences for temperature dependent devices Shunpei Ando; Tatsuro Honda; Satoshi Kobayashi 責任著者, Poster Abstracts of DNA 29, #2-26号, 出版日 2023年09月, 査読付 研究論文（国際会議プロシーディングス）, 英語2023 · 論文

• 制御信号系列によって多機能性を実現する分子計算システムの理論とその設計基盤の構築 小林 聡 日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 電気通信大学, 基盤研究(B), 研究代表者, 外部から信号系列を与えることによってさまざまな計算機能を実行することのできる分子コンピュータの設計基盤を与えるために，未知の振舞いをもつ制御付き計算モデルの理論，信号に応答する DNA デバイスの開発，DNAデバイス設計のための配列設計システムの構築，複数の DNA デバイスのシステム化に向けたデータや知見の蓄積を行った．理論と実験の連携をしながら，システム化においては，不可逆性の度合いに応じて機能を区分けして設計することの重要性を認識した．また，新しい光応答性塩基の開発により，１塩基レベルの入力の違いを情報処理に反映する技術を得た．これは，新しい制御付き計算モデル開拓への大きな刺激となった．, 19H04204 研究期間 2019年04月 - 2022年03月2019 · 共同研究・競争的資金等の研究課題
• 分子ロボティクスの支援と広報 萩谷 昌己; 小長谷 明彦; 村田 智; 齊藤 博英; 小林 聡; 藤本 健造 日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 東京大学, 新学術領域研究(研究領域提案型), 領域メンバー全員の出席する領域会議を9回行った．公開シンポジウムを年1回開催し，2017年7月に最終公開シンポジウムを開催する予定である．研究会は19回開催した．国際会議併設公開シンポジウムを2回主催した． HP (http://www.molbot.org)から情報発信を続け，年4回のペースでニュースレターを発行した． 学部学生を対象とする国際生体分子デザインコンペティションの支援を行った．国内予選5回を主催し，解説書を執筆した（国際委員会により英訳される予定）．高校生を対象とした講習会ひらめき☆ときめきサイエンスを2回実施した．企業向けのビジネス展にブースを4回出展した．, 24104001 研究期間 2012年06月 - 2017年03月2017 · 共同研究・競争的資金等の研究課題
• 新学術領域「分子ロボティクス」 「知能分子ロボット実現に向けた化学反応回路の設計と構築」（計画研究） 小林 聡 日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 電気通信大学, 新学術領域研究(研究領域提案型), 研究代表者, 本研究課題では，知能を備えた分子ロボットのためのDNAを用いた化学反応回路の設計論を提示すると同時に，新学術領域「分子ロボティクス」の他班との共同研究により，分子ロボットプロトタイプの創製に貢献した．主要な結果としては，光応答性の人工塩基を用いた高速な計算デバイスの開発，環境の変化に適応できる化学反応系の例の実装，さらに，デバイス間の濃度ギャップ問題を解決し得る高性能な1000 倍の濃度増幅器の開発が挙げられる．この増幅器は，分子ロボットプロトタイプの創製に大きな役割を果たした．また，分子ロボット開発に有効な，リアクティブな化学反応系の設計論と分子ロボット群のための分散計算理論を構築した．, 24104003 研究期間 2012年06月 - 2017年03月2012 · 共同研究・競争的資金等の研究課題
• 分子ロボティクスのための反応系解析アルゴリズムの理論 小林 聡; 山下 雅史; 村田 智; 鈴木 泰博; 小宮 健; 葛谷 明紀; 瀧ノ上 正浩 日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 電気通信大学, 基盤研究(C), 本研究では,分子がさまざまな形で干渉して多くのアセンブリを生成するような複雑な化学反応系の平衡状態を効率良く計算するための理論を確立した.この理論では,ハイパーグラフの理論と最適化理論を統合して利用することにより,化学平衡を計算するために必要な変数の個数を削減することに成功した.この理論を核酸配列の干渉系に応用した.また,この理論を拡張してRNAのフォールディングシミュレーションを近似的に高速に実行することに成功した., 22500010 研究期間 2010年 - 2012年2010 · 共同研究・競争的資金等の研究課題

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