琉球大学 · 医学部 · 講師

研究关键词非結核性抗酸菌・感染症・微生物学・呼吸器ウイルス・免疫学・結核・SARS-CoV-2・抗体親和性

研究领域免疫学・呼吸器内科学・感染症内科学・細菌学

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• Complete genome sequence of a metallo-β-lactamase-producing Aeromonas dhakensis strain, RYU-Ah62, isolated from a patient with an abdominal abscess2024 · Naoya Nishiyama, Kohei Uechi, Wakako Arakaki, Daisuke Utsumi, Yukuto Sato, Masashi Nakamatsu, Takeshi Kinjo, Kazuko Yamamoto
• Detection of community-acquired respiratory viruses during COVID-19 pandemic in subtropical region in Japan2024 · Wakaki Kami, Takeshi Kinjo, Hiroe Hashioka, Wakako Arakaki, Ami Takahashi, Shohei Yogi, Kohei Uechi, Shiro Maeda, Kazuko Yamamoto, Jiro Fujita
• Rebound mortality rate of Legionella pneumonia in Japan2023 · Yamasue M, Komiya K, Kinjo T, Ito A, Yamaguchi T, Iwanaga N, Ishii M, Tateda K, Kawakami K.
• Clinical Utility of SARS-CoV-2 Antibody Titer Multiplied by Binding Avidity of Receptor-Binding Domain (RBD) in Monitoring Protective Immunity and Clinical Severity2023 · Etsuhisa Takahashi, Takako Sawabuchi, Tetsuya Homma, Yosuke Fukuda, Hironori Sagara, Takeshi Kinjo, Kaori Fujita, Shigeru Suga, Takashi Kimoto, Satoko Sakai, Keiko Kameda, Hiroshi Kido

• COVID-19ウィルスゲノムシーケンシングによるワクチン・薬剤耐性関連変異株・海外変異株の予防的国内監視システムの構築2021 · ■■■
• SARS-CoV-2感染者に誘導された抗体の感染防御能と交叉免疫性解析2021 · ■■■
• インドネシアに流行する抗酸菌のゲノム疫学研究2020 · 2020年度はリアルタイム同定システムの構築を行った。これまでに我々が開発してきたMLSTをベースとした解析手法を用いることで、ゲノムサイズの10倍程度という少量のデータがあれば、NTMの菌種同定を亜種レベルで行うことができることが、これまでの検討により判明していた。そこでシークエンス中にリアルタイムに配列が得られる次世代シークエンサーであるMinIONを用いてこの手法を拡張することで、シークエンスを行いながら解読されたゲノム配列を用いて菌種同定を行うリアルタイム解析システムを開発した。開発した解析システムを大阪大学内のオンプレミスの計算ノード群上に構築し、計算ネットワーク基盤を構築した。この解析システムではMinIONシークエンサーに直接接続されデータの取得を担う末端計算ノードと、配列解析を行う計算ノードが分離しても動作するように設計されており、病院検査室等でシークエンスされたデータがインターネットを介してリアルタイムに解析が行われる。これにより、MinIONシークエンサーに接続された計算機が大阪大学内のオンプレミスへシークエンスデータを送信・解析が行われるため、病院検査室の検査担当者は情報科学の専門知識なしに高精度な菌種同定結果を得ることが可能となった。 2021年度以降は、海外共同研究者である Karuniawati 副医学部長の協力のもと、この解析システムをインドネシア大学およびその連携病院へ導入し、インドネシアにおける結核の疫学調査の実施を進める。
• 日本と台湾における肺アブセッサス症の原因亜種分布と臨床像解析、および臨床分離株の遺伝子相同性を調査する後ろ向きコホート研究

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