Fukui Prefectural University · Faculty of Marine Bioresources · 准教授

Research keywords微生物生態学・分子生物学・バイオインフォマティクス・嫌気・好気培養・海洋性微生物

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• Ruji KONDO* and Takafumi KATAOKA, 「Kamagatella elastica gen. nov., sp. nov., an anaerobic bacterium representing the novel family Kamagatellaceae fam. nov. within the order Tissierellales, isolated from a xenic culture of an anaerobic bacterivorous protist」, 『Antonie van Leeuwenhoek』, 2026, Accepted on April 1, 2026.2026 · Takafumi KATAOKA*, Yuki Sato-TAKABE, Yunosuke NAKAMURA, Takuhei SHIOZAKI, Yuya TSUKAMOTO and Satoshi HANADA, 「Seasonal variation in bacterial community composition in the brackish meromictic Lake Suigetsu」, 『 Antonie van Leeuwenhoek』, 2026, vol.119:1, 10.1007/s10482-025-02212-7.
• Takafumi KATAOKA*, Takehiro NAKAMURA, Ippei MIKI, and Rei SOMIYA 「Spatiotemporal distributions of inorganic nutrients in a hypoxia forming saline lake, Lake Hiruga in Japan」, 『Limnoogy』, 2025, Vol.26, pp. 311–322.2025 · Takafumi KATAOKA*, Ryo SUGIMOTO, Atsushi KANEDA, Haruyo YAMAGUCHI, Takahito RIHEI and Shinya YAMASHITA, 「Seasonal variation in the community distribution of protists off Wakasa Bay, Southern Sea of Japan」, 『Continental Shelf Research』, 2023 vol.253(15):104898.
• 2018年に実施した首都大学東京のチームとの共同研究で三方五湖における細菌群集構造を調査した研究。水月湖の細菌群集構造を4季節・3水深・異なる粒子サイズの3つで比較した研究です。これまでは、硫黄代謝細菌やシアノバクテリアなど特定の種類を対象とした研究が行われてきましたが、本研究では、16S rRNA遺伝子をマーカーとして細菌の種類を区別せず網羅的に調べました。水月湖の細菌群集の全体像だけでなく、秋に淡水と共に特定の細菌が水月湖の深層にまで流入する現象が確認されました。2018 · 2016年に日向湖（三方五湖、福井県）から単離培養されたStramenopilesに属する細菌補食原生生物HIYC8株の細胞内微細構造と18S rRNA遺伝子解析により分析し、Bicosoecid目の新属新種として提案しました。捕食口辺縁部内の微小管が6～8本と比較的少ないことおよび、捕食口の片側が大きく開くことから「日向湖から単離された、大きく開く単細胞生物」という意味のHirugamonoas aperioesと命名しました。2019～2021年度の3名の卒論研究の成果です。
• 2016年から2018年にかけて福井県立大学と福井水産試験場で実施した、若狭湾のモニタリングプロジェクトの成果。若狭湾を縦断して真核微生物の4季分布を調べた研究です。通年優占する種類は、渦鞭毛藻類（Dinoflagellata）に加えて緑藻（Chlorophyta）であることが明らかになりました。Chlorophytaでは、未培養系統とされてきたprasinophyte Clade VIIが夏季から秋季にかけて優占していましたが、Pycnococcus類、Ostreococcus類、Mamiellophyceae類は冬季から春季にかけて優占するという違いが認められました。2016 · 硫酸還元菌のタイプ種、Pseudodesulfovibrio portus JCM 14722Tの全ゲノム配列が未解析だったために実施した研究。ゲノム解析に貢献しました。

• 従属栄養原生生物の単離株を用いた細菌摂食による炭素輸送過程の再評価
• 亜寒帯沿岸生態系における陸域起源栄養塩利用の評価
• 環境中の細菌捕食性原生生物の増殖特性定量法の開発と実証
• 水圏の底泥中における嫌気性原生生物による有機物の分解・無機化

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