The Graduate University for Advanced Studies, SOKENDAI · Institute for Molecular Science

Research keywordsreaction path optimization・transition states・elastic network models・computational chemistry・molecular dynamics・ATPase regulation

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• A Correlated Flat-bottom Elastic Network Model for Improved Bond Rearrangement in Reaction Paths DOI: 10.26434/chemrxiv-2024-4vrx9-v2 出版年: 2024 URL: https://researchmap.jp/shinichikoda/published_papers/472426372024 · 論文一覧（最新5件）
• Locating Transition States by Variational Reaction Path Optimization with an Energy-Derivative-Free Objective Function DOI: 10.1021/acs.jctc.3c01246 出版年: 2024 ジャーナル名: Journal of Chemical Theory and Computation URL: https://researchmap.jp/shinichikoda/published_papers/470213572024 · 論文一覧（最新5件）
• Flat-Bottom Elastic Network Model for Generating Improved Plausible Reaction Paths DOI: 10.1021/acs.jctc.4c00792 出版社: American Chemical Society (ACS) 出版年: 2024 ジャーナル名: Journal of Chemical Theory and Computation URL: https://researchmap.jp/shinichikoda/published_papers/470213582024 · 論文一覧（最新5件）
• 出版年: 20242024 · 論文一覧（最新5件）

• シアノバクテリア時計タンパク質振動子の出力分子機構の理論的解明 2022-2024 キーワード: 反応経路探索, 遷移状態探索, 体内時計, 概日リズム, シアノバクテリア, KaiB, 最小エネルギー経路, 反応モデル URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K14652/2022 · 研究課題一覧（最新5件）
• 時計タンパク質における時空間階層運動の協奏が創る機能発現機構の理論的解明 2018-2021 キーワード: 体内時計, シアノバクテリア, 時計タンパク質, 数理モデル, 概日リズム, 反応モデル, ATP加水分解, 階層性, シミュレーション URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18K14185/2018 · 研究課題一覧（最新5件）
• シアノバクテリア時計タンパク質振動子の出力分子機構の理論的解明研究課題一覧（最新5件）
• キーワード: 反応経路探索, 遷移状態探索, 体内時計, 概日リズム, シアノバクテリア, KaiB, 最小エネルギー経路, 反応モデル研究課題一覧（最新5件）

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