The Graduate University for Advanced Studies, SOKENDAI · Institute for Molecular Science

Research keywordsmolecular dynamics・reaction coordinates・dynamin membrane constriction・mitochondrial ATP synthase・IF1 regulation・Na-pumping mechanism・membrane transport proteins・coarse-grained simulation

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• 出版日: 2025-03-132025 · CiNii Articles（最新５件）
• Investigating the hyperparameter space of deep neural network models for reaction coordinates 著者: 川島, 恭平, 佐藤, 拓海, 岡崎, 圭一, 金, 鋼, 松林, 伸幸, 森, 俊文 出版日: 2025-03-13 出版社: AIP Publishing ジャーナル名: APL Machine Learning キーワード: Molecular dynamics, Electrostatics, Information theory entropy, Artificial neural networks, Machine learning, Monte Carlo methods, Isomerization, Reaction mechanisms, Peptides, Gaussian processes URL: https://cir.nii.ac.jp/crid/10503040181475889922025 · CiNii Articles（最新５件）
• Membrane Constriction by Dynamin through GTP-Driven Conformational Changes from Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulations DOI: 10.1021/acs.jpclett.5c02867 出版年: 2025 ジャーナル名: The Journal of Physical Chemistry Letters URL: https://researchmap.jp/keokazaki/published_papers/511917662025 · 論文一覧（最新5件）
• 出版年: 20252025 · 論文一覧（最新5件）

• AlphaFoldと分子シミュレーションの統合による分子モーターの構造変化制御 2025-2026 キーワード: 生体分子モーター, 分子シミュレーション, AlphaFold, 構造予測AI, ATP合成酵素 URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-25H02299/2025 · 研究課題一覧（最新5件）
• 細胞膜変形分子マシンの動作メカニズム：多量体形成と構造変化による膜変形の理論研究 2022-2025 キーワード: 細胞膜変形分子マシン, 分子シミュレーション, ダイナミン, 粗視化モデル, 構造変化, 生体分子マシン, 細胞膜, GTP URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K23858/2022 · 研究課題一覧（最新5件）
• トランスポーターの基質輸送速度を変える変異の理論的予測 2018-2020 キーワード: トランスポーター, 分子動力学シミュレーション, 遷移パス, 基質輸送速度, 疎水性ゲート, 生体膜マイクロチップ URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18H02415/2018 · 研究課題一覧（最新5件）
• キーワード: トランスポーター, 分子動力学シミュレーション, 遷移パス, 基質輸送速度, 疎水性ゲート, 生体膜マイクロチップ研究課題一覧（最新5件）

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