Institute of Science Tokyo · Institute for Advanced Studies · 教授

Research keywords人工知能・Cancer・合成生物学・システム医学・research・AI創薬・Internal・クリニカルインフォマティクス

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• Yuki Otani, Daisuke Koga, Yasunari Wakizaka, Hideyuki Shimizu. BaCNet: Deep Learning Accelerates Novel Antibiotic Discovery Against Resistant Pathogens bioRxiv. 2025.03; ( DOI )2025
• Takumi Ito, Satoshi Ohno, Yiran Wang, Saori Uematsu, Shinya Kuroda, Hideyuki Shimizu. MetDeeCINE: Deciphering Metabolic Regulation through Deep Learning and Multi-Omics bioRxiv. 2025.03; ( DOI )2025
• Takumi Ito, Kohei Ota, Hidekazu Hishinuma, Hideyuki Shimizu. A Functional Atlas of the Tardigrade Resistome Reveals a Diverse Molecular Toolkit for Extremotolerance bioRxiv. 2025.06; ( DOI )2025
• Yuki Otani, Daisuke Koga, Yasunari Wakizaka, Hideyuki Shimizu. AMP-Atlas: Comprehensive Atlas of Antimicrobial Peptides to Combat Multidrug-resistant Bacteria bioRxiv. 2025.03; ( DOI )2025

• 人工知能と理論化学の融合による中分子創薬プラットフォーム
• 医薬品としての出口を目指した潜在空間探索のための化合物マルチパラメーター精密推定
• システム生物学・人工知能で迫るがんの個別化治療戦略
• 人工冬眠ペプチドのデザイン法則の発見と治療応用

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